肠系膜上动脉压迫综合征患者需卧床休息，补充液体及电解质，内科治疗无效时需进行手术治疗。
一、一般治疗
1、患者需卧床休息，最好采用俯卧位、侧卧位。禁食、胃肠减压，维持水、电解质与酸碱平衡及静脉营养支持等。
2、餐后俯卧位或侧卧位有利于食物通过，必要时服用促胃肠道动力药。
3、恶心、呕吐明显者静脉补充液体及电解质，经对症处理多数患者可逐渐缓解症状。
二、药物治疗
1、多潘立酮：多潘立酮属多巴胺受体拮抗剂，多巴胺能降低胃及食管下括约肌节律，扰乱胃窦、十二指肠运动的协调性，多巴胺受体拮抗剂通过选择性阻滞多巴胺受体，而发挥促动力效应。
2、莫沙必利：莫沙必利属5-HT4受体激动剂，可增强食道、胃、十二指肠及小肠的协调运动，促进消化系统的排空，且对结肠运动、胃肠激素和内脏敏感性均有影响。
三、手术治疗
保守治疗效果不显著及无效的患者，应给予手术治疗，以恢复肠道通畅。手术方式可选用：
1、十二指肠空肠吻合术：十二指肠空肠吻合术是最常用的手术方式，手术效果确切。游离十二指肠，将靠近十二指肠悬韧带的空肠与十二指肠梗阻近端吻合，吻合口应尽可能靠近梗阻部位并要大于5cm。
2、十二指肠悬韧带松解术：十二指肠悬韧带松解术，切断十二指肠悬韧带同时切开部分后腹膜，使十二指肠水平不下移，适用于十二指肠空肠悬韧带过短、悬吊固定位置过高者。
3、十二指肠血管前移位术：如有可能，切断受压迫部位的十二指肠远侧，并将十二指肠从肠系膜上动脉的后方拖出，在肠系膜上动脉前方行十二指肠空肠吻合。
4、毕罗Ⅱ式胃空肠吻合术：毕罗氏Ⅱ式胃空肠吻合术 是在胃大部切除后，将十二指残端闭合， 而将胃的剩余部分与空肠上段吻合，此法优点是胃切除多少不因吻合的张力而受限制，胃体可以切除较多，临床应用广泛。
5、十二指肠环形引流术：距十二指肠悬韧带10~15cm处切断空肠做胃远侧部分切除，远侧端空肠于结肠后与十二指肠球部端端吻合，于此吻合口下方10~15cm处行胃空肠端侧吻合，再于胃肠吻合口下方15~20cm处行近侧空肠与远侧空肠端侧吻合。
目前，国际上以十二指肠空肠吻合术和十二指肠悬韧带松解术作为治疗本病的主要手术方式。