功能性消化不良属于排除性诊断
1、C13呼气试验：年龄＜40岁或无吞咽困难、呕血、黑粪、贫血、体重下降、发热等症状者，只需要常规检测幽门螺旋杆菌、C13呼气试验，如果阳性，建议根除。
2、全血生化检查：可以通过肌酐值或者天冬氨酸转氨酶的血值来判断患者的肝功能和肾功能有无异常。
3、幽门螺旋杆菌检查：门诊可以通过碳13或者碳14的检查来检查患者是否存在幽门螺旋杆菌感染的情况。
4、胃镜检查：对年龄＞40岁或有吞咽困难、呕血、黑粪、贫血、体重下降、发热等症状者，应及时进行胃镜检查，排除胃部器质性如消化性溃疡、胃食管反流病以及胃部恶性病变，如胃癌。
5、腹部B超：有消化道症状的患者还需要完善腹部B超检查，排除肝炎、胆囊炎或胰腺疾病导致的消化道症状。