重症肌无力是自身免疫性疾病，是神经肌肉接头传递障碍疾病，所以凡引起或加重神经肌肉接头传递功能障碍的药物要禁用或慎重应用。尤其是禁用肌肉松驰药，包括琥珀酰胆碱和筒箭毒碱。还要尽量避免应用麻醉药和镇静安眠等，尤其是病情严重呼吸不利患者必须避免应用，否则抑制呼吸，加重病情，甚危及生命。抗菌素中有些影响肌肉接头传递，如氨基甙类抗菌素如链霉素、卡那霉素、庆大霉素等以及多肽类多粘菌素E，还有四环素类的金霉素和土霉素等都应尽量避免。降低肌膜兴奋性的药物如奎宁、奎尼丁、普罗卡品等也要禁用。另外，普萘洛尔、苯妥英钠、青霉胺及寒凉的中药也要慎重应用。