根据婴儿因肠痉挛哭吵的剧烈程度，采取分级治疗。轻者通过抚慰、按摩、热敷等方式减缓婴儿哭吵，同时可服用二甲基硅油及解痉药等药物，较严重者可通过改变患儿饮食的方式予以治疗。
一、一般治疗
1、第一级治疗：给孩子以抚慰，摇动孩子，减低环境噪音，用热水袋捂婴儿腹部，可适当服用二甲基硅油。
2、第二级治疗：可用解痉药(如西托溴铵)能阻断平滑肌的毒覃碱型受体，还可直接作用于平滑肌，解除平滑肌痉挛。
3、第三级治疗：改变饮食，如母乳喂养的母亲不食用牛奶、奶制品、鱼和蛋类，人工喂养的婴儿给予豆奶或水解酪蛋白的奶方。
二、药物治疗
1、二甲基硅油：是一种非吸收性药物，通过改变气泡表面张力，使气泡融合或弥散，促进气体排出，对人体无副作用。可用来减少肠道气体。
2、解痉药物：
（1）西托溴铵：能阻断平滑肌的毒覃碱型受体，还可直接作用于平滑肌，解除平滑肌痉挛。
（2）盐酸双环胺：为一种抗胆碱能药物，具有阿托品样的解痉作用，并有一定的中枢安定作用，在治疗婴儿肠痉挛方面有一定疗效。但有研究发现，6个月以内的婴儿用此药可发生呼吸暂停，因此需谨慎选择使用，不可在家自行服用。
3、扑尔敏：具有抗过敏及镇静作用、弱的抗胆碱活性和弱的止吐作用，对于肠痉挛的缓解具有一定的作用。
三、手术治疗
该病一般无需手术治疗。
四、其他治疗
一些中药具有解痉作用，有研究表明服用中药(洋甘菊、马鞭草、甘草、苗香、香蜂草及薄荷组成的粉末)7天后，患儿肠痉挛有改善。