小脑扁桃体下疝手术需要俯卧位，在枕后做切口。手术方式是后颅窝减压、硬脑膜扩大修补和下疝小脑扁桃体切除。首先要去除后颅窝的颅骨，然后将硬脑膜切开，用人工脑膜腱扩大修补脑膜，这样能够解除对于前方脑干的压迫，另外如果小脑扁桃体下疝超过0.8厘米，还需要将下疝的小道扁桃体切除。手术过程中用显微镜操作，这样能够尽量的避免对于血管和脑干的损伤。