急性上呼吸道感染大约有200多种病毒可引起，急性上呼吸道感染约有70%-80%是由病毒引起的，包括鼻病毒、冠状病毒、腺病毒、流感和副流感病毒，以及呼吸道合胞病毒、埃可病毒和柯萨奇病毒。
另外20%-30%的上呼吸道感染为细菌引起，可单纯发生或继发于病毒感染之后，多见于口腔定植溶血性链球菌，然后为流感嗜血杆菌、肺炎链球菌、葡萄球菌等。针对于上呼吸道感染的治疗，目前尚无特殊的抗病毒药，以对症治疗为主，同时要戒烟、注意休息、多饮水、保持室内空气的流通，以及防治继发细菌感染。如果已经发生细菌感染，可给予常规的消炎药，头孢类的或者喹诺酮类抗生素。