甲状腺癌在进行手术以后，很多患者可以见到甲状腺球蛋白降低，但并非所有的患者球蛋白水平都偏低。在甲状腺癌术后，如果是进行了甲状腺的全切或者清扫，由于甲状腺被全部切除，甲状腺球蛋白的来源就没有了，此时甲状腺球蛋白水平就会比较低，这时候可以通过观察甲状腺球蛋白水平的变化情况来判断手术是否成功以及术后的复发情况。长期的甲状腺球蛋白偏低是提示了甲状腺癌的复发几率较低，如果突然出现甲状腺球蛋白水平的升高，就要考虑复发的风险增高，复发的可能性增大。
但是对于没有全部切除的甲状腺癌的患者，甲状腺球蛋白水平并不一定降低，此时的评估是要结合在术前和术后稳定情况下甲状腺球蛋白的水平来判断。