肱骨外科颈骨折的治疗分为手术及非手术治疗，各种方法的适应症多年来一直未能形成统一的认识。目前除治疗的目的统一之外，有关处理的很多方面一直是争议不断。其治疗目的是骨折复位，对于内侧皮质塌陷的予以积极矫正并恢复力线，恢复关节的活动功能。
一、保守治疗
闭合整复外固定主要分为石膏和夹板两类固定方法，且在临床中应用也较为普遍，其中以连肩夹板外固定法和U型石膏外固定法的临床治疗效果最为理想，后期需要进行循序渐进的功能锻炼。
二、药物治疗
急性期可给予塞来昔布、艾瑞昔布、双氯芬酸钠等镇痛治疗。药物治疗只是暂时缓解症状、减轻不适，属于对症治疗。
三、手术治疗
手术治疗的方法主要有闭合穿针内固定、闭合带锁髓内针加空心钉内固定、切开复位钢板内固定、改良克氏针张力带内固定等。主要手术方式包括：
1、髓内钉固定治疗：髓内钉固定治疗肱骨外科颈骨折造成的创伤较小，能够保留骨折断端血供，可获得较高优良率。严重移位骨折，选择带锁髓内钉的方法治疗，尤其合并出现肱骨干骨折选择此种方法治疗有显著效果。对于改良带锁髓内钉，于近端主要利用螺旋刃锁钉有效完成角稳定，同普通带锁髓内钉进行比较，可增加骨内固定物解除效果，减少骨小梁劳损。用髓内钉固定方法治疗肱骨近端骨折，主要包括两种，分别为单针固定的方法以及多针固定的方法。
2、钢板内固定治疗：肱骨近端锁定钢板(LPHP)治疗缺点为存在广泛的手术暴露，会导致骨折周围软组织损伤，进而破坏血运，导致骨折无法愈合，增加肱骨头缺血坏死。优点是骨折固定稳定性较好，钢板为根据患者肱骨近端解剖形状加以设计的角稳定性钢板，可以肱骨近端牢固固定，骨质疏松性骨折可以获得显著效果。
3、闭合复位经皮穿针固定术治疗：此种方法治疗可以防止过多对软组织造成剥离，促进骨折的愈合，降低肱骨头缺血坏死概率，配合早期肩关节功能锻炼可以获得显著效果。选择中空加压螺纹钉治疗可以获得理想效果，不但可以将骨折断面进行有效固定，加强骨折稳定性，并且骨折断面有一定的压应力，对骨折断面紧密接触有促进作用，可缩短骨折愈合时间，降低并发症概率。同时选择骨片钉治疗，在骨端加压以及固定强度均可以获得显著效果。
4、人工肩关节置换术治疗：人工关节置换术主要适用合并骨质疏松症的粉碎性骨折、关节面累计损伤超过2/5的压缩性骨折及不可重建的肱骨劈裂患者。关节稳定性差、骨质损伤严重者如用其他复位治疗难以达到良好的复位及愈合效果，可使关节严重畸形、坏死等发生，导致肩功能障碍。人工肩关节置换术主要包括两种，分别为半肩关节置换术及全肩关节置换术。肱骨外科颈骨折主要选择全肩关节置换术以及选择半肩关节置换术治疗。为了避免出现结节移位以及出现骨折愈合不佳的情况，在实施人工假体置换手术时结节部需要进行修复。当骨折未愈合或未成功应实施切开复位，内固定失败后选择肱骨头置换术的方法补救，可以获得显著效果。人工肱骨置换术治疗可缓解疼痛症状，但是完成后手术后对肩关节活动有限制。
四、物理治疗
可辅以局部中药熏蒸仪、艾灸等治疗，促进深部淤血吸收，使局部肿胀早日消退，为日后关节功能恢复创造条件，并大大减少日后关节的残留隐痛。
五、中医治疗
中医认为骨折早期局部的经脉受损，血溢脉外，淤积于肌肤，拥阻于经脉，故在骨折治疗的早期应以活血化瘀、消肿止痛为主要治疗目的。至中后期，患者由于骨折导致气血亏虚，此时应以滋补肝肾、强筋壮骨为主要治疗目的。同时配合应用中药内服和外用，进而达到促进局部血液循环，活血化瘀的效果。
六、其他治疗
功能锻炼是肱骨外科颈骨折后取得良好效果的重要环节，具体方法应根据骨折的类型、稳定性，固定的牢固程度来决定。目前常用的功能锻炼分3个阶段，即被动功能锻炼、主动功能锻炼及加强活动范围和力量锻炼。