小阴茎矫正术包括阴茎延长和增粗，一般可联合进行，但也有禁忌症，如果小阴茎合并如下疾病者则视为禁忌症，不适合做手术。
1.测定黄体激素（LH）、卵泡刺激素（FSH）、睾酮（T）和双氢睾酮（DHT）的水平及染色体等检查异常者。
2.患者期望过高、认为阴茎增大能解决包括婚姻生活、改善男性形象等所有问题的患者不宜接受手术。
3.凝血功能障碍者。
4.糖尿病未控制者。
5.外阴感染未控制者。