肾小球疾病的治疗，包括去除诱因、一般治疗，以及针对病因和发病机制、合并症的治疗和肾脏替代治疗。
一般治疗包括避免过度劳累、去除感染等诱因，避免接触肾毒性药物或毒物，采取健康的生活方式，如戒烟、戒酒，注意休息适当锻炼以及合理饮食。
针对病因和发病机制的治疗，包括采用激素或免疫抑制剂治疗自身免疫性疾病，控制血压、高血脂、高血糖、高尿酸、蛋白尿等非免疫因素来治疗。
并发症的治疗包括控制血压、控制心脑血管疾病、纠正肾性贫血，以及纠正骨矿物质代谢异常等。
对于已经进入终末期的肾小球疾病，需要采取肾脏替代治疗，如血液透析、腹膜透析和肾移植。