胃、十二指肠溃疡通常需治疗3~6个月，长者1~2年，治疗周期视具体病情而定。该疾病应去除病因，控制症状，患者注意停服不必要的药物。幽门螺杆菌感染是胃、十二指肠溃疡的重要病因，根除幽门螺杆菌可以治愈溃疡或降低溃疡复发风险。本病多用抑酸剂、黏膜保护剂口服治疗，也可以用内镜下治疗或胃大部切除术。
一、药物治疗
1、H2受体拮抗剂：H2受体拮抗剂是主要药物之一，疗效好，用药方便，价格适中，长期使用不良反应少。常用药物有法莫替丁、尼扎替丁、雷尼替丁，6周愈合率分别为80%~95%和90%~95%。
2、质子泵抑制剂：质子泵抑制剂是治疗消化性溃疡的首选药物，主要有奥美拉唑、雷贝拉唑、兰索拉唑、泮托拉唑等。入血，进入到胃黏膜壁细胞酸分泌小管中，酸性环境下转化为活性结构，与质子泵即H+-K+-ATP酶结合，抑制该酶的活性、从而抑制胃酸的分泌。
二、手术治疗
胃、十二指肠溃疡，对于内科治疗，保守治疗无效的患者可考虑手术治疗。术后并发症：术后胃出血、十二指肠残端破裂、胃肠吻合口破裂或瘘、术后梗阻等并发症，濒危患者禁用。
1、内镜手术：内镜治疗根据溃疡出血病灶的内镜下特点选择治疗策略。溃疡出血的内镜下治疗，包括溃疡表面喷洒蛋白胶、出血部位注射1：10000肾上腺素、出血点钳夹和热凝固术等，有时采取2种以上内镜治疗方法联合应用。
2、胃大部切除术：胃大部切除术是治疗胃溃疡的手术方式，是将大部分胃切除，胃残端于十二指肠吻合。其优点是未改变胃肠通道，维持人体胃肠道正常生理结构，术后恢复比较快，并发症相对较少,患者进食后有异常的感觉。