如果孩子身体里缺乏维生素D，实际上会导致机体为了去维持正常的血钙水平，从而去调动骨骼，从而对骨骼造成损害，也就是发生孩子佝偻病的各种骨骼损伤。骨骼本身是非常重要的，非常容易被利用的钙源，会去调动骨骼里面的钙释放，来维持细胞外液的钙浓度正常，所以这也就是常说的，查血钙大部分不会太低，而这时候骨钙可能会比较低了。
维生素D缺乏会造成肠道吸收钙、磷减少，血钙的水平降低，从而就会导致身体里的甲状旁腺功能代偿性亢进，甲状旁腺素分泌增加，这时候就会动员骨骼释放出骨钙，然后去维持血清的钙浓度，在一个正常的或者接近正常的水平，但这时候因为骨钙的释放，所以实际上骨骼里的钙质会受到影响。另外由于血清的钙、磷浓度不足，本身骨骺、软骨的正常生长和钙化也都会受阻，包括整个长骨的生长都会受到影响，就会导致一系列骨骼相关的异常改变，从而使孩子出现佝偻病。