细菌性阴道炎不能做人工流产手术。在做人工流产手术之前，必须做阴道分泌物常规检查，如果确定有细菌性阴道炎，必须先治疗阴道炎，可以阴道内塞入甲硝唑治疗，也可以口服甲硝唑或者奥硝唑。如果有阴道炎症不经治疗，就做人工流产手术的话，有发生子宫内膜炎或者子宫肌炎的可能，严重的会引起盆腔炎症，还有可能会引起继发性不孕。