疼痛是肾结石最常见的伴随症状，大多数的肾结石患者临床是以腹痛或者是腰痛来就诊，从而发现肾结石的。肾结石导致的疼痛主要表现在肾区疼痛，有的患者可表现为活动后出现的上腹部或腰部的钝痛。输尿管结石患者可引起肾绞痛，表现为剧烈的疼痛，阵发性发作，疼痛沿输尿管走行方向，可以放射至两侧的腹股沟或者是大腿根。