生殖器上出现水泡常见的原因包括：1.存在不洁性接触史，即和爱人或性伴侣以外的一个人或多人发生过性接触，由此，可能感染了生殖器疱疹病毒，表现为环冠状沟周围或近阴茎头的阴茎体处出现团簇样透明状小米粒大小水泡，若是这样需要到正规医院检验疱疹病毒，如果真的被证实得了生殖器疱疹，需要口服阿昔洛韦等抗病毒药物及外用阿昔洛韦乳膏，2.另外也存在感冒后出现病毒定植于阴茎处，也表现出水泡。