对于小儿急性肾小球肾炎，临床上一般无特异性治疗，主要是对症治疗、清除体内残余病原，治疗原则是纠正病理、生理变化及生化异常，同时防治急性期并发症，保护肾功能，以利其恢复。
一、药物治疗
1、抗感染治疗：有感染灶时用青霉素10~14天，对青霉素过敏者可改用大环内酯类。疑有其他病原时，可加用其他抗生素。
2、对症治疗：
（1）利尿：经控制水、盐入量后仍水肿、高血压、少尿者可予利尿药，一般口服氢氯噻嗪，无效时需用呋塞米口服或注射，还可采用新型利尿合剂，利尿效果优于单用呋塞米。
（2）降压：凡经休息，控制水盐摄入、利尿而血压仍高者均应给予降压药，首选钙通道阻滞剂(CCB)类降压药，如硝苯地平，如血压仍不能控制可用血管紧张素转化酶抑制剂(ACEI)或血管紧张素Ⅱ受体拮抗剂(ARB)类药物，如尼卡地平、卡托普利、哌唑嗪等口服。
3、严重循环充血的治疗：矫正水钠潴留，尽快利尿降压，应以使用利尿剂和血管扩张剂为主，慎用或小量使用强心剂，常用呋塞米静脉注射，对难治病例可采用腹膜透析或血液滤过治疗。
4、高血压脑病的治疗：原则为选用降压效力强而迅速的药物，首选硝酸酯类药物，如硝普钠。
5、急性肾功能不全的治疗：严格限制液体，纠正水电解质酸碱平衡紊乱，去除加重急性肾损伤的可逆因素，上述保守治疗无效后，尽早行透析治疗。
二、手术治疗
小儿急性肾小球肾炎如进展到肾衰竭阶段，血液透析治疗效果不佳，必要时可进行肾脏移植手术。