一跑步肚子就疼的原因可能有：1、肠管痉挛、肠炎等，在运动过程中，由于肠管会随着运动，可能会诱发肠管痉挛、肠炎，导致腹部锐痛。同时可能伴随腹泻、腹胀等症状。2、泌尿系病变，例如肾结石、输尿管结石、肾积水、输尿管积水等。在运动过程中，导致结石也在运动，刺激肾脏、输尿管等，就会出现腹部钝痛，可能伴随红色小便等。3、考虑是否有腹壁肌肉损伤，特别是近期重体力劳动或运动导致的腹部肌肉损伤没有恢复好，运动后加重损伤出现的疼痛。