卵巢囊肿分为生理性囊肿和病理性囊肿，生理性囊肿比较常见的是黄体囊肿、滤泡囊肿，这种生理性囊肿一般跟月经周期相关，观察2-3个月经周期大多数可以消失，生理性囊肿的患者可以不用任何药物治疗，定期随诊就可以了。
如果是病理性囊肿，吃药是无效的，还是建议手术治疗，手术治疗的同时可以明确囊肿性质，除外恶性病变。此外，也可以预防远期的并发症，比如卵巢囊肿破裂、囊肿蒂扭转等情况，因此卵巢囊肿可以用辅助的中成药，但效果往往都不好，生理性囊肿是可以不用药的，病理性囊肿根本治疗还是依赖于手术治疗。