抗结核药物按照疗效和不良反应大小，可以分为一线抗结核药物和二线抗结核药物。一线抗结核药物主要包括利福平、异烟肼、吡嗪酰胺、乙胺丁醇、链霉素，二线抗结核药物从药效和安全性都不如一线药物，但是用在一线药物耐药或者不良反应不能耐受时，选择二线药物，常用的有左氧氟沙星、莫西沙星、卡那霉素、阿米卡星、对氨基水杨酸等。
对于结核治疗，如果是耐药结核，治疗上比较复杂，疗程也比较长。耐药又可以分为单耐药、多耐药、耐多药及广泛耐药几种情况，所以耐药结核的治疗也可以分为A、B、C、D四组药物。其中A组是指喹诺酮类的药物，B组是二线注射类的药物，C组是其他的核心二线药物，D组附加药物，也包括D1、D2、D3三类药物。