童年情绪障碍的发病原因很多，其发病与遗传因素、个人心理素质、社会家庭因素密切相关，常伴有诱因。好发于身体存在缺陷的儿童、有精神障碍家族史的儿童、经历来自于外界过大的刺激，性格抑郁的儿童。
1、遗传因素：儿童情绪障碍与遗传因素有关，如敏感、多疑、易怒、悲观等情绪特质或人格特征可具有遗传倾向，而具有易患性的患儿在不良环境因索的作用下容易出现儿童情绪障碍。
2、环境因素：家庭气氛紧张、不良的教养方式、亲子关系问题、对孩子的苛刻要求及过分保护等均可影响儿童正常的心理发育，从而易发生情绪障碍。其次为社会和教育因素，如不良的社会环境、学习负担过重、对孩子的期望值过高等也是儿童发生情绪障碍的重要因素。
3、心理因素：幼年期的精神创伤及严重的精神刺激对该病的发生具有重要作用，如亲属死亡、父母离异、监护人虐待等事件发生，造成一些列严重的精神刺激。
4、躯体因素：因某些躯体疾病、残疾或畸形，使儿童社会适应能力下降，难以适应日常的生活和学习环境，从而易引起儿童情绪障碍。