检查肾结核可以做PPD试验，也可以检测血的抗结核抗体。另外尿的抗酸染色也可以检测，终极还需要做尿的结核分枝杆菌的培养。如果病人出现腰痛，有午后低热、盗汗等情况，如果还有血尿等，这时应怀疑肾结核的可能性，这时通常会让病人去做PPT试验，如果PPT试验阳性，一般还会要求病人去做抗结核抗体。如果这两个方面都是阳性，这时会让病人做尿常规检查，看尿中有没有抗酸杆菌。
如果尿中有抗酸杆菌，这时要求病人做尿的结核分枝杆菌培养，但是因为这种培养需要很长的时间培养不出来，所以有时如果临床上分析有肾结核的可能，这时通常也会在等待结核分枝杆菌培养的过程中，给抗结核的经验性治疗。如果经验性治疗以后，病人的体温下来，症状得到有效的控制，这时认为可能有肾结核的情况。