小儿肺脓肿的病因为病原体感染所致，以金黄色葡萄球菌、厌氧菌感染最多见，其次为肺炎链球菌、流感嗜血杆菌、溶血性链球菌、克雷伯杆菌、大肠埃希杆菌、铜绿假单胞菌等。另外，还可继发于其他疾病。
一、主要病因
1、细菌感染：是感染金黄色葡萄球菌、厌氧菌感染以及肺炎链球菌、流感嗜血杆菌、溶血性链球菌、克雷伯杆菌、大肠埃希杆菌等细菌所致。
2、疾病因素：患有肺炎或败血症等可以继发小儿肺脓肿，而且小儿体内其他脏器感染传播到肺部所致。
3、外物吸入：小儿深睡时吸入异物等，堵塞支气管，最终引发肺部炎症导致肺脓肿。
4、其他因素：胸部外伤以及小儿内部脏器出血或淤血导致感染，引发小儿肺脓肿。
二、诱发因素
1、细菌感染：环境中存在大量致病菌，即长期住院或停留于其他人群密集环境中。
2、支气管阻塞：多发于本身患有肺炎的儿童，可能出现支气管阻塞、排痰不畅等。
3、机体抗感染能力低下：原发或继发性免疫功能低下，包括长期感染、营养不良、使用激素类药物等。
4、胸部受过外伤：容易导致肺部感染，从而引发该疾病。