磁共振对神经痛的诊断具有临床意义，比如三叉神经痛，因三叉神经痛的病因比较常见的是三叉神经其周围受到相应血管的压迫，通过磁共振扫描可以明确诊断。比如坐骨神经痛，通过磁共振检查也能明确诊断，坐骨神经痛最常见的原因是腰椎间盘突出压迫到坐骨神经引起，磁共振扫描可以明确病变周围是否存在压迫。不是所有的神经痛通过磁共振检查均能明确病因，比如带状疱疹引起的后遗神经痛。