尿路感染要根据感染的部位、感染的轻重程度，来选择不同的治疗方法。如果是轻度感染，患者自身抵抗力比较正常，一般可以采取多喝水、清淡饮食、注意休息的方法，很多人可以自愈。如果患者有比较明显的症状，出现尿频、尿急、尿痛，甚至血尿、下尿路感染，可以首选口服药物治疗，常用的有左氧氟沙星、头孢地尼、磷霉素、阿奇霉素等等。非复杂性的感染，一般口服3-5天即可以痊愈。如果是反复感染或者是复杂性感染，疗程应该适当延长，可以采用1-2周的疗程，根据症状的缓解程度以及化验的结果来决定疗程。
对于上尿路感染，也就是肾盂肾炎，如果有腰痛、发热等全身症状，一般建议采用静脉抗生素治疗，常用的有左氧氟沙星、依替米星、头孢噻肟，病情严重时可以采用万古霉素等进行治疗。通常体温正常，症状控制满意以后，改为口服药物继续控制，疗程通常比较长，一般上尿路感染建议治疗的疗程是两周以上。