对于心肌炎的治疗在急性期应该严格卧床休息三个月以上，可以使用抗病毒药物，如利巴韦林进行治疗，必要的情况下需要使用干扰素、转移因子等进行调节免疫功能的治疗。
心肌炎的炎症治疗包括使用自由基清除剂，使用改善心肌营养代谢的药物，如辅酶Q10、维生素C等，以及中成药物的治疗，重症的心肌炎患者需要考虑使用糖皮质激素进行治疗。
对于出现并发症的心肌炎患者，如心律失常或心衰，需要对心律失常和心衰进行相应的治疗。