原发性血小板增多症确切的发病原因还不清楚，发病机制可能与血小板生成素和血小板生成素受体的改变、基因的异常激活有关，50%的患者有JAK2V617F基因突变。
一、主要病因
1、骨髓造血干细胞克隆性增殖：基因突变导致巨核细胞增殖。
2、血浆血小板生成素水平及其受体的改变：正常情况下血浆中的血浆血小板生成素水平。与循环池中血小板数量及骨髓中巨核细胞数量成反比。然而研究发现，在原发性血小板增多症患者中，不管血小板的数量及骨髓巨核细胞数量如何，血浆血小板生成素水平通常是正常或升高。
3、巨核祖细胞对血浆血小板生成素敏感性的改变：无人重组巨核细胞生长因子刺激的CD+34细胞可以自发分化，进而导致原发性血小板增多症发生。
二、诱发因素
1、病毒感染：各种病毒感染使白细胞计数较高，骨髓增生更活跃。
2、化学物质的接触：化学物质的接触使体内产生有毒物质，可促使多能干细胞克隆性增殖。