卡尔曼综合征患者由于下丘脑-垂体-性腺轴障碍，下丘脑不能正常分泌GnRH，致使脑垂体分泌促LH和FSH减少，最终导致睾丸分泌睾酮(T)减少，进而引起性腺功能减退。
卡尔曼综合征是一种遗传病，目前尚不能治愈，无有效预防方法，但是及早发现接受综合有效的治疗可控制症状，以满足生育需求。有家族病史者要尽早筛查，一旦出现疑似卡尔曼综合征临床表现，要及时寻求医生帮助，接受治疗是避免疾病进展的有效方法。