女孩疝气手术后遗症一般有顽固性疼痛、疝气复发等。顽固性疼主要是因为手术过程中导致神经被切断，或者是在缝合的时候缝合线落在骨膜等位置导致的；而疝气复发主要是因为手术之前诊断不够明确，从而导致手术存在有遗漏等因素导致的。虽然会存在后遗症，但这些后遗症都是比较轻微的，且出现的概率较低，因此患者还是可以采取手术做治疗的。