慢性头痛的诊断首选要明确头痛的原因，区分是原发性或是继发性，具体有以下几点诊断标准：
1、通过临床表现，即患者存在头痛症状，同时可以伴有恶心、呕吐等表现。头痛持续大于3个月以上，可初步确诊为慢性头痛。
2、结合病史(包括头痛家族史、睡眠情况、心理状态等)、体检、颅脑CT等检查，可初步判断病变部位，如颅脑疾病或者血管疾病等。如要诊断原发性头痛，需要排除继发性头痛。
3、综合病史、腰椎穿刺脑脊液检查等，进一步明确慢性头痛的病因诊断。