高位肛瘘和低位肛瘘是以外括约肌深部划线为标志区分的，瘘管经过此线以上为高位肛瘘，经过此线以下为低位肛瘘。低位肛瘘手术相对简单，可以采取瘘管切除术或Lift手术。高位肛瘘手术难度有所增加，可采取瘘管部分切开挂线术，以防止一次性切开，括约肌回缩而造成大便失禁。肛瘘手术成功的关键在于正确的处理内口，术后的换药也是至关重要的。