当靶向药物引起腹泻的症状，并不是太严重时可以给病人口服保护肠道黏膜的药物，如蒙脱石散。这个药物可以在病人肠道表面形成保护膜，减少水分向肠腔内的渗出，从而减轻腹泻的情况。必要的时候还可以口服黄连素进行止泻的治疗，同时要特别注意病人的饮食，不要吃油腻、煎炸、烧烤的食物，也不要吃不容易消化的食物，以免加重肠道的负担。
如果靶向药物引起的腹泻非常严重，甚至一天腹泻十余次，常常需要降低靶向药物的用量，或者是延长靶向药物的用药间隔，从而减轻腹泻的症状。当这些症状经过上述的处理获得好转之后，也可以逐渐恢复靶向药物的用量。对于靶向药物治疗之后出现明显腹泻的病人，需要特别注意维持体内的水和电解质平衡。