目前对于沟纹舌的病因尚无统一意见，根据国内外学者流行病学调查结果，提示可能与下列因素有关：
1、年龄因素，有报告新生儿沟纹舌发病率为0.8%，随着年龄的增长发病率有所增加，60岁以后上升趋势停止。
2、地理环境、人种及营养因素，存在高发人群现象，常与这些因素有关。
3、全身疾病因素，银屑病、梅罗综合征、干燥综合征以及伤寒、梅毒感染、唐氏综合征、天疱疮等常伴发沟纹舌。
4、遗传因素，精神迟钝患者发病率明显增高，并发现有高发家系。
5、其他因素，如病毒感染等感染以及迟发性的变态反应、苔藓样变等。
如果得了沟纹舌，而没有临床症状，不需要治疗，但应做好解释工作，消除患者的恐惧心理。