瞳孔异常的原因较多，通常询问病史以及检查即可明确，通常包括疾病因素和非疾病因素。
一、疾病因素：
1、眼部病变：眼部病变主要导致的是瞳孔对光反应异常，主要是由于瞳孔括约肌麻痹、偏盲性瞳孔强直等原因造成。
2、颅内病变：颅内病变是引起瞳孔异常的常见原因，例如颞叶钩回疝可引起单侧瞳孔缩小。颅内病变引起的小脑幕切迹疝、眼眶内肿瘤、动眼神经麻痹等疾病，是引起单侧瞳孔散大症状的常见原因。
二、非疾病因素：
1、发育异常、阿托品类药物中毒等非疾病因素，均会导致瞳孔异常。
2、有机磷类农药中毒、镇静类安眠药中毒等，是引起双侧瞳孔缩小症状的原因。