小儿中毒性脑病和小儿病毒性脑炎区别主要是病因、症状等方面的不同。从病因方面来说中毒性脑病是因为毒素进入大脑导致脑细胞受到损害引起的；而病毒性脑炎多数是因为受到肠道病毒等感染导致的。从症状方面来说，病毒性脑炎早期症状主要是发热感染症状起病，而中毒性脑病早期症状通常有头痛，头晕，嗜睡等。但不管是哪一种疾病，确诊之后都应该要尽早做治疗。