氟牙症的治疗原则为恢复牙齿的功能和美观，阻断并发症的发生。治疗包括脱色治疗以及修复治疗等。
1、脱色治疗：无实质性缺损的氟牙症患牙可采用，如用过氧化物类进行漂白，之后可联合使用渗透树脂以便得到更好的效果。脱色治疗后随时间延长可能颜色会复发，如果氟牙症染色程度较深，脱色治疗可能不能达到理想的脱色效果。
2、修复治疗：有实质性缺损的氟牙症患牙可行复合树脂粘接修复或瓷贴面、全冠修复。修复治疗虽然美观，但修复体需自身加以维护，可能会脱落，其中复合树脂修复可能发生着色。