亚急性甲状腺炎的治疗周期主要有以下两种情况：1、不伴有甲状腺功能异常的亚急性甲状腺炎，这种情况一般是针对局部的症状给予对症治疗，如发热给予退热治疗，局部疼痛给予止痛治疗，必要时给予糖皮质激素治疗，这种情况的治疗周期约8周左右；2、伴有甲状腺功能异常的亚急性甲状腺炎，这种情况除了需要局部对症治疗外，还需要给予甲状腺激素替代治疗，纠正甲状腺功能减退，患者的治疗周期约在12周左右，少数患者可发展成永久性甲减。