由于目前的CT设备非常先进，对人体没有太大危害。一次头颅CT检查的辐射剂量略高于人类暴露于自然界的辐射剂量，不用恐慌和担心。
如果没有特殊需要，不建议孕早期妇女和新生儿做头颅CT检查，而且也不建议一个患者近期多次进行不必要的头部CT检查。大剂量的CT暴露，会增加癌症和血液系统疾病的发病风险，会增加胎儿的致畸率。