蛋白S偏低是由疾病因素或非疾病因素引起，具体如下。
一、疾病因素
1、获得性PS缺乏：可见于肝病如肝硬化、急性肝炎、慢性活动性肝炎，以及维生素K缺乏症、急性呼吸窘迫综合征、弥散性血管内凝血等。
2、先天性PS缺陷症：也称遗传性PS缺陷症，是一种常染色体显性遗传病，临床上以静脉血栓形成为主要表现。
二、非疾病因素
在口服避孕药、抗凝药物时，以及妊娠和新生儿可出现蛋白S偏低。