治疗脑血栓的药物有以下几种：
第一、溶栓药物，溶栓是目前最重要的恢复血流措施，重组组织型纤溶酶原激活剂（rtPA）和尿激酶，是我国主要使用的溶栓药物。
第二、抗血小板聚集药物，对于不符合溶栓适应症，且无抗血小板禁忌症的脑血栓患者，应在发病后尽早给予口服阿司匹林或氯吡格雷的抗血小板治疗。
第三、降纤药物，对不适合溶栓，并经过严格筛选的脑血栓患者，特别是高纤维蛋白血症者，可选用降纤治疗，常用的药物包括巴曲酶、降纤酶等。
第四、神经保护药物，依达拉奉是一种抗氧化剂和自由基清除剂，能改善脑血栓的功能结局，其安全性较高。
第五、丁苯酞治疗，丁苯酞可改善侧枝循环，从而改善症状。