药物的两重性是指药物进入机体后可产生对机体有益的治疗作用，同时也可能产生对机体有害的不良反应。药物的有些不良反应是与药物的药理作用有关的，是可以预测的，比如，抗菌药可能引起肠道菌群的紊乱，进而导致抗生素相关性腹泻。而药物的有些不良反应是与药物的药理作用无关的，是无法预测的，存在有很大的个体差异的，比如对药物的过敏。由于药物作用的这种两重性，因此用药前应该对治疗方案进行充分的利弊权衡。