附睾炎分为急性附睾炎和慢性附睾炎，对于急性附睾炎，建议立即采取抗生素静点，通常选择的敏感药物有菌必治或者左氧氟沙星，症状一般可以在1-2周左右得以控制。
为了预防急性附睾炎转成慢性附睾炎，即使症状得以控制，还是建议病人口服2周左右的抗生素。在治疗急性附睾炎期间病人要绝对卧床休息，同时抬高阴囊，如果这期间阴囊肿大，可以采取冷敷的方式缓解肿胀。
针对于慢性附睾炎，目前治疗手段不多，抗生素治疗往往无效，可以采用中医对症治疗，选择桃仁、红花、三七类的活血药物缓解病人的疼痛。
另外，需要指出的是在基层医院，针对慢性附睾炎有些人应用热水坐浴、微波或者理疗进行治疗，可是这样做有风险，对于没有怀孕以及有生育要求的患者来讲，这种加温的热疗容易造成不孕不育，一定要慎重选择。