肾囊肿手术的类型比较多，常见的手术方式有肾囊肿穿刺引流硬化术、腹腔镜下肾囊肿去顶减压术、肾囊肿切除术等。
1.肾囊肿穿刺引流硬化术：是在B超或者CT定位下行囊肿穿刺引流硬化术，其手术创伤小，适用于年龄较大或合并其他基础疾病，不适合手术的患者。但此种治疗手段较为局限，且有损伤肾脏的风险，而且对于较大囊肿复发率高。
2.腹腔镜下肾囊肿去顶减压术：随着腹腔镜技术的推广，现在临床上用得最多的是腹腔镜下肾囊肿去顶减压术，手术创伤小，术后囊肿的复发率低，逐渐成为肾囊肿治疗的“金标准”。
3.肾囊肿切除术：此类手术可通过开放式手术或腹腔镜手术进行，多用于解除囊肿引起的压迫梗阻症状或切除可疑癌变病灶。