肾上腺囊肿的治疗方式主要为手术治疗，具体如下：
1、传统开放手术：因创伤大、术后恢复较慢等，现目前已较少使用。
2、腹腔镜手术：具有创伤小、术后恢复快等优点。主要有经腹与经腰两种途径：①对于右侧肾上腺囊肿，囊肿较大或靠近肝脏位置，多采用经腹途径，经腹途径具有空间大的优点，可以充分游离囊肿周围组织，避免对肝脏的损伤。②对于左侧肾上腺囊肿，一般采用经腰途径，可避免损伤或干扰腹腔脏器，且具有不破坏腹膜的优点。
3、腹腔镜肾上腺囊肿去顶术：目前主要应用的术式，但术前应做肾上腺内分泌检查除外有功能的肾上腺肿瘤。