甲状腺肿瘤需要与结节性甲状腺肿、亚急性甲状腺炎、颈部淋巴结转移、甲状舌管囊肿进行鉴别。
1、结节性甲状腺肿：甲状腺多发结节，病程较长，多发生在缺碘人群。细针穿刺病理学检查可鉴别。
2、亚急性甲状腺炎：因病毒感染引起，甲状腺触诊较硬，同时伴有疼痛，化验显示血沉较快，甲状腺超声也与甲状腺肿瘤不同。
3、颈部淋巴结转移：其他恶性肿瘤也会引起无痛性颈部淋巴结转移，需仔细鉴别。
4、甲状舌管囊肿：一种先天性的畸形疾病，多见于儿童及青少年。甲状舌管囊肿触摸时会有囊性感，而甲状腺肿瘤触摸时多为实性，可以通过年龄、病史及超声进行鉴别。