掌跖脓疱病需要做的检查，主要包括皮肤镜检查、皮肤活检，由于此类病症具有较为显著的体表特征，所以通过皮肤镜检查可以较为快速进行初步确诊。皮肤活检是从患处取出一块皮肤，并将其送至病理学实验室进行组织病理学检查，可以明确病变的具体类型。
掌跖脓疱病的鉴别诊断，主要为脓疱型银屑病，脓疱型银屑病患者局部组织会出现有海绵样脓疱，并且周围会出现有皮屑脱落现象，体表形态上与掌跖脓疱病存在一定差异性。此外，还需与肢端性皮炎鉴别，肢端性皮炎引起的脓疱常发生于指、趾末端，并且附近组织会出现有沟纹舌现象。