金匮肾气丸在临床的应用周期至少为三个月，金匮肾气丸可以温补肾阳、化气行水，用于肾虚水肿、腰膝酸软、小便不利、畏寒肢冷，因此用于多种疾病的治疗，如前列腺增生、神经源性膀胱、弱精症、糖尿病以及勃起功能障碍等。在泌尿外科金匮肾气丸是治疗肾阳虚证的经典方药，主治虚劳腰痛、少腹拘急、小便不利。临床研究表明精亏肾气丸在泌尿外科可以改善患者的尿频、尿急及夜尿增多等症状，并且具有抗利尿及抗衰老和改善夜尿次数的作用。同时金匮肾气丸可以显著提高中老年男性雄激素缺乏综合征患者的勃起功能状况，从而达到改善勃起功能的目的。