早期扁桃体恶性肿瘤的症状相同于慢性咽喉炎的症状，如：咽部不适、异物感，一侧咽部疼痛等，往往容易误诊为咽喉炎类疾病。随着肿瘤的生长，肿瘤表面可出现溃疡和糜烂。晚期扁挑体恶性肿瘤出现同侧疼痛加剧，并可以向同侧耳部放射，吞咽时疼痛更甚；由于疼痛自感，吞咽水和食物可出现困难并会逐渐加重，说话时可出现口中含物，含糊不清，同侧颌下或颈部可出现淋巴结肿大等。