肾结石手术有多种做法，通常要根据患者的具体情况来选择。有体外碎石、输尿管软镜，以及经皮肾镜的方法，具体如下：
1、体外碎石：如果结石比较小，在体内停留时间短，可以采用体外碎石的方法，将结石击碎以后自行排出。
2、输尿管软镜：如果结石在2cm以内，体外碎石效果不佳，可以选择输尿管软镜的方法。输尿管软镜可以弯曲，因此可以探查到肾盂以及各个肾盏的分枝，将结石打碎以后取出，但是软镜纤维鞘比较细，碎石相对较慢。
3、经皮肾镜：遇见超过2cm的结石，或者是多发结石，也可以考虑采用经皮肾镜的方法，经皮肤、皮下组织、肌肉、肾脏打一通道，然后直接将结石击碎，从通道内将结石吸出。这种情况结石碎石效率比较高，清石比较快，适合比较大的结石。
总之，各种手术方法都有一定的适应症和禁忌症，应该根据具体情况和医生共同商议以后决定。