1、根据感染时间，可分为以下三类：
（1）先天感染(经胎盘传播)：在生后2周内证实有活动性CMV感染的病毒学证据。
（2）围生期感染：在生后3～12周内尿中开始排病毒者，主要经产道、母乳、生后不久多次输血引起。
（3）后天获得性感染：在出生12周以后开始排病毒者，主要经水平传播获得。
2、根据感染来源，可分为以下两类：
（1）初次感染：又称原发感染，为初次感染巨细胞病毒。
（2）再发感染：在免疫功能减退时潜伏病毒活化繁殖或再次感染外源性病毒则称再发感染。
3、其他分类：根据感染症状，可分为无症状型感染和症状性感染，前者多见于儿童，后者多见于先天性感染和免疫缺陷者。