飞蚊症的治疗要根据不同病因进行不同治疗，需先做眼科检查。如果飞蚊症是由于眼器质性病变造成，例如视网膜破孔，需要眼底激光封闭裂孔。如果由眼底出血造成，需要止血治疗。还有一些人是因为玻璃体后脱离、玻璃体变性造成，玻璃体后脱离不需要特殊治疗，需要密切观察病情发展，一旦出现器质性病变需要相应治疗。
排除了器质性病变之后，单纯的飞蚊症不需要治疗，没有特别有效的药物和手段，仅需要临床观察。如果黑影突然增多、视力有明显下降，或者眼前闪亮光，出现大片红色、黑色影，需要到门诊及时就诊，以防止漏掉器质性病变的可能性。